Первый отдел
- Отдел договорной работы и учета недвижимого имущества
Финансово-экономическое управление
- Отдел нормирования и оплаты труда
- Отдел бюджетного планирования и финансового обеспечения
- Контрактная служба
- Отдел доходов
- Центр коммерциализации ФЭУ ДВГУПС
- Отдел бухгалтерского учета, отчетности и мониторингов
- Отдел учета НФА
- Отдел расчетов по заработной плате и стипендии
Управление правовой работы и внутреннего аудита
- Отдел правовой работы
- Отдел внутреннего аудита
Управление делами и кадровой политики
Управление международной деятельности
- Международный отдел
- Отдел рекламно-выставочной деятельности
- Отдел "Офис иностранных студентов"
- Подготовительное отделение "Центр русского языка"
Управление по информационным технологиям
- Отдел WEB-разработки и сопровождения программного обеспечения
- Отдел системного администрирования
- Отдел мультимедийных технологий
Учебно-методическое управление
- Сектор статистики и итоговой аттестации
- Сектор расчета и учета учебной работы
- Диспетчерская служба
- Отдел лицензирования и аккредитации
- Отдел образовательных программ
- Отдел региональных подразделений и СПО
- Отдел комплектования и каталогизации фондов
- Отдел основного хранения фондов
- Отдел учебной литературы
- Отдел научной литературы
- Отдел методического и технического сопровождения
Центр компетенций и сертификационного тестирования
Управление по воспитательной работе и связям с общественностью
- Отдел поддержки молодежных инициатив
- Центр координации воспитательной деятельности
- Служба по связям с общественностью
- Студенческий клуб
Управление социальной политики и спортивно-оздоровительной работы
- Учебно-оздоровительная база «Локомотив»
- Спортивно-оздоровительный комплекс в с. Андреевка
- База для проведения практических занятий по геологии и геодезии в с. Петропавловка
- Учебно-спортивный комплекс ДВГУПС
- Администрация
- Общежитие №2
- Общежитие №3
- Общежитие №4/1
- Общежитие №4/2
- Общежитие №5
- Общежитие №6/1
- Общежитие №6/2
- Общежитие №1 ХТЖТ
- Общежитие №2 ХТЖТ
Управление аспирантуры, докторантуры и подготовки научных кадров
- Отдел организационно-технической работы
Редакция журнала «Социальные и гуманитарные науки на Дальнем Востоке»
Редакция журнала «Транспорт Азиатско-Тихоокеанского региона»
Отдел мобилизационной подготовки (второй отдел)
Служба охраны
Управление штаба по делам гражданской обороны и чрезвычайным ситуациям
Служба безопасности, сигнализации и связи
Центр управления партнерством, карьеры и практики
- Отдел материально-технического снабжения
- Отдел по содержанию зданий и сооружений
- Отдел технического контроля
Управления инженерных коммуникаций
- Отдел главного механика
- Отдел главного энергетика
Управление научно-исследовательских работ
- Отдел научного и инженерного маркетинга
- Отдел сопровождения научных и инженерных работ
- Сектор результатов интеллектуальной деятельности
- Отдел научно-инновационной работы студентов
Конструкторское бюро РНЛТ
Научно-исследовательские лаборатории
- Изысканий
- Основания и фундаменты
Научно-инженерные центры
- Испытательная лаборатория «ДВ-Материал»
- Испытательный центр строительных материалов, изделий и конструкций «ДВГУПС-Стройтест»
Общественные организации
- Профком студентов
- Профком сотрудников